Соляна кислота токсична. По ступені впливу на організм відноситься до речовин 3-го класу небезпеки за ГОСТ 3118-77.
Гранично припустима концентрація пари соляної кислоти в повітрі робочої зони виробничих приміщень - 5 мг/м3.
Соляна кислота подразнює та припікає слизові верхніх дихальних шляхів, уражає легені. При потраплянні на шкіру викликає важкі опіки. При своєчасному змиванні водою залишається почервоніння, у протилежному випадку кислота швидко проникає усередину тканин, зявляється струп. При відпадінні струпу залишається глибока виразка. При великій площі ураження шкіри можлива загибель. У 30% працівників, руки котрих постійно в роботі стикаються з 3% розчином кислоти, спостерігається розпушення шкіри на руках, виразки, хронічні гнійники біля нігтів, ін. Дуже важкими є наслідки потрапляння кислоти в очі.
На повітрі "димить" в результаті виділення хлористого водню и притягання ним вологи повітря з утворенням кислотного туману.
Подразнююча дія хмари соляної кислоти виявляється вже при 1 мг/м³. У здорової людини рефлекторні зміни дихання можуть відмічатися при 0,35-5 мг/м³. Крім подразнення верхніх дихальних шляхів, утруднення дихання, спазма голосової щілини, печіння в очах, при більш високих концентраціях можуть зявитися кровава мокрота, блювота (іноді з кровю), пізніше важкі запалення бронхів та легенів.
Виробничому персоналу необхідно проводити всі роботи у спеціальному одязі та засобах індивідуального захисту (костюм з бавовняної тканини, гумові чоботи, гумові рукавички, захисні окуляри, фільтруючий промисловий протигаз за ГОСТ 12.4.121, марки БКФ).